一般情况下，高温连栋大棚的通风是降低高温连栋大棚内空气温度和湿度，进行气体交换，提高二氧化碳浓度的有效手段。但在冬季低温时期，通风换气不能按照通常的方法来做，比如利用早晨的通风来达到降湿、排湿就是不正确的，这与夏季或秋季的通风是不同的。冬季棚内温度较低，晚上一般在10℃～15℃，后半夜湿度多在95%～100%。同样在冬季棚外温度更低，常在0℃以下，在晴天刚揭开草苫时，棚内空气中的二氧化碳浓度最高，为保证棚内蔬菜对二氧化碳的需求，不使二氧化碳因通风造成浪费，这时不要急于通风，而应在揭开草苫后1小时再通风。若过早揭开草苫通风，冷风进入高温连栋大棚内会产生雾，湿度不降返升，导致湿度没有降下来，温度却降了下来，对蔬菜生长不利。

正确的做法是：在冬季早晨先不通风，随着室外光照强度的增加和温度的升高，高温连栋大棚内温度也迅速升高，自然降湿。这是高温连栋大棚内作物光合作用的最佳时段，作物光合作用发生后，室内二氧化碳浓度会迅速降低。当室内温度升高到一定程度后（一般不超过25℃）应及时开窗通风，引进新鲜空气（因新鲜空气中含有约3%的二氧化碳），同时排出高温连栋大棚中的湿气，降低空气的相对湿度。通风时先开小口，这时的主要目的是缓慢排出棚内的湿气，防止果实表面的露水急剧干燥导致裂果。随着棚内温度的升高，再逐渐将通风口加大，以利于棚外二氧化碳进入棚内，促进蔬菜的光合作用。到下午也不要一次性将通风口关闭，因为通风口关闭后棚内的温度又会上升，这样覆盖草苫后容易导致夜温过高，加大植株对叶片制造有机物质的呼吸消耗。应逐渐将通风口关闭，可先将通风口关闭一半，30分钟后完全关闭通风口。也可先将通风口关闭，然后再将通风口打开通风降温10～15分钟，如此重复两次，当棚内温度稳定在15℃左右时即可将通风口完全关闭。
通风换气后，高温连栋大棚通风口应在覆盖保温被前半小时关闭，以便提升高温连栋大棚内的温度。通风应在中午12时至下午2时进行，将通风口开到宽10厘米即可，每次通风10～15分钟，每20～30分钟通风1次，连续通风2～3次即可起到很好的降湿作用。
如果遇到连阴天，外界温度较低时，高温连栋大棚应以保温为主，但不可因此不通风。如果不通风，棚内湿度过大，就会为病害的浸染、传播提供条件。因室外温度比较低，光照条件又比较差（如阴天）时，日光高温连栋大棚可能整天都不能开窗通风。在这种情形下，应适当增施有机肥，以便缓慢释放出二氧化碳，保证作物正常生长。